他独自步行前往巴黎，大约在1528年2月初抵达巴黎。在巴黎，他和一些西班牙人住在一起，到蒙太古学院（College of Montaigu）去上课。由于他升学太快，他又回到了低年级，因为他觉得自己在很大程度上缺乏适当的基础。因此，他在一个有孩子的班级里学习。当他刚到巴黎时，他收到了一位商人从巴塞罗那寄来的二十五枚金币。他把这些钱交给一个和他一起生活的西班牙人保管。这个商人很快将这笔钱挥霍没了，无法偿还。结果是，当四旬期结束时，依纳爵发现自己已身无分文，他被迫以乞讨为生，离开了自己居住的房子。

随后，他被收容于靠近诸圣婴孩教堂的圣詹姆斯医院。这个住处给他的学习带来很大困难。不仅医院离学院很远，而且早上，根据院方规定，他必须等到天亮才能出门，并且晚上，他必须在打三钟经钟之前回来，否则不能入院。因此，他既不能准时去上课，也不能把所有时间花在学习上。他还发现了另一个困难，那就是他必须花一些时间去讨饭。

依纳爵过着严格的斋戒和苦行的生活，近五年来没有经历过内在精神上的痛苦。他在医院度过了一段时间后，发现自己在文学方面的进步很小，便考虑该怎么办。他注意到，许多大学讲师的仆人都有充足的学习时间。于是他决定找一个大学老师做主人，他做仆人。他仔细地考虑了这件事，心想：“我所服事的主人是基督，他的一个学生叫伯多禄，另一个叫若望，其余的学生叫其他宗徒的名字。然后，当我的主人给我一个命令时，我要想是基督命令了我。当其他人发出命令时，我要认为命令来自圣伯多禄或其他宗徒。”这种想法让他感到一丝丝的安慰。他为找到一位老师绞尽脑汁，并向一位学士和一位认识许多老师的迦太基的会士以及其他人讲述了这件事，但始终未能找到一位合适的老师。

由于实在没有人救济依纳爵，一位西班牙会士告诉依纳爵，他每年可以去佛兰斯（Flanders）寻求施舍，保证两个月内就能得到足够一整年的物资。依纳爵采纳了他的建议，并把这件事完全托付给天主。果然，他每年都从佛兰德斯带得到大量的施舍来维持生活。甚至有一次，他来到了英国，从那里得到了比往年更多的施舍。