依纳爵已经二十六岁了，醉心于世界的各种虚幻之中。他尤为喜爱军旅生活，被追求功名利禄的强烈愿望所引导。当时帮布罗纳的一座城堡被法国军队包围，他是城堡内的一名军人。因为获胜无望，大家再也坚持不下去了，所以所有城堡内的守卫都希望以自由离开为条件投降。但是依纳爵不顾其他贵族们的意见，劝说指挥官坚决抵抗敌人，防守到底。
法军攻城的那天，依纳爵向他的一位贵族战友告了罪（不是告解圣事），他的战友也同样向他告了罪。城墙被攻破了，依纳爵依然勇敢地坚持战斗。直到一个炮弹炸断了他的一条腿，另一条腿也受了重伤，他才失去了战斗的能力。
他一倒下，守军立即向法国人投降。当法国人占领了整个城堡时，他们对依纳爵深表敬佩。依纳爵在帮布罗纳停留了十二天或十五天，受到了法国军医最好的治疗，之后他们用担架把他送回了他的老家罗耀拉。他的伤口恢复的非常缓慢，家里人从各个地方召集医生前来给他会诊。由于腿接的不合适或者由于路上的颠簸导致错位，因此愈合的希望渺茫。医生们一致认为应该将腿折断后重新再接。他同意了医生们给他做手术。在手术过程中，正如他遭遇痛苦时的一贯作风，只是攥紧拳头一言不发，始终没有表现出疼痛的样子。
在手术期间，他的身体越来越虚脱。再后来，他已不能进食，表现出濒死的症状。在圣若翰纪念日那天，医生们放弃了治疗，并建议他办临终告解。在圣伯多禄和圣保禄纪念日那天，依纳爵领了圣事。当天晚上，医生说，如果他在子夜还没有好转，必死无疑。依纳爵之前特别敬礼圣伯多禄，所以天主准许他在这夜开始好转。
他恢复的如此之快，以至于几天之后就脱离了危险。骨头已经开始愈合，但因为一块骨头压在了另一块骨头上，所以在他的膝盖以下隆起了一个大包，这也导致他的一条腿长比另一条腿短。他的腿看起来极度变形。因为他打算将来要进入皇宫供职，所以他无法忍受如此难看的腿。于是他问医生是否能再为他做手术。医生回答说，可以，但是因为伤口已经愈合，所以这会给他带来比之前更大的痛苦。然而，为了心中的梦想，他决定接受这种折磨。
依纳爵的哥哥对此既惊讶又钦佩。他说，如果换做他，他绝没有如此勇气去接受这种痛苦。当突出的骨头和肉被切除后，为了使手术的这条腿和另一条腿一样长，这条腿必须用外力强制拉长。这样一连几天，给依纳爵带来了巨大的痛苦。最终天主赏赐他逐渐地恢复健康，虽然他脱离了生命危险，但不能站立，只能躺在床上。
